大丈夫です。
何の問題もありません。

ただし、喉が炎症を起こしていて痛みがある場合には、
口を開けて喉へ照射する代わりに、喉に外側から（肌の上から）、
ライトとの間にガーゼなどの薄い布を挟み、密着させての照射をお勧めします。